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水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析
水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析
作者:
刘显军
李生强
邹杰
陈刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻
乙烯应答因子(ERF)
生物信息学
亚细胞定位
表达分析
摘要:
乙烯应答因子(ethylene responsive factors,ERFs)是一类植物特有的转录因子,在植物的生长发育和逆境胁迫响应中起重要调控作用.为了研究水稻(Oryza sativa)OsERF103基因(GenBank No.XM_015768788)的功能,本研究利用生物信息学方法对其序列特征进行分析;构建了pBWA(V)HS-OsERF103-Glosgfp融合表达载体并转化水稻原生质体,通过激光共聚焦显微镜观察融合蛋白在水稻原生质体的亚细胞定位;利用qRT-PCR技术对该基因在水稻不同组织及不同逆境胁迫下的表达模式进行分析.结果表明OsERF103含有1个AP2(APETALA2)结构域,为亲水性蛋白,不含信号肽和跨膜结构,在进化关系上与短舌野生稻(Oryza brachyantha)类脱落酸阻遏因子1(abscisic acid repressor 1-like,ABR1-like)蛋白的亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示OsERF103定位于细胞核;qRT-PCR分析结果显示,OsERF103在孕穗期的根、茎、叶、叶鞘、叶枕和幼穗中均有表达,其在根中表达最强,在叶和幼穗中表达较弱;OsERF103被高温、低温、PEG6000、高盐和脱落酸(abscisic acid,ABA)诱导表达,但在不同的胁迫条件下该基因表达模式不尽相同.本研究为进一步研究水稻OsERF103基因的功能提供了基础资料.
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文献信息
篇名
水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
水稻
乙烯应答因子(ERF)
生物信息学
亚细胞定位
表达分析
年,卷(期)
2019,(12)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
2130-2139
页数
10页
分类号
S511
字数
6909字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2019.12.005
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期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
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