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摘要:
为研究香蕉MAPK1的序列特征及其在不同激素处理、逆境胁迫下的表达趋势,以‘天宝蕉’为材料,采用RT-PCR技术克隆MaMPK1并对其进行生物信息学分析和不同处理下的表达模式分析.结果显示该基因编码区长为1 182bp,可编码393个氨基酸.其编码蛋白具有STKc_TEY_MAPK结构域,属于MAPK基因家族TEY亚型A亚家族,是不稳定的脂溶性亲水酸性蛋白,无信号肽和跨膜结构,有多个磷酸化位点.亚细胞定位预测结果显示MaMPK1主要定位于细胞核.蛋白互作预测结果显示该蛋白与HSFA4A存在互作,暗示其可能在香蕉抗热反应过程中发挥作用.启动子顺式作用元件预测结果显示MaMPK1启动子包含多种激素和逆境胁迫相关作用元件.定量分析结果显示MaMPK1的表达受SA、45℃、低温和盐胁迫抑制,受茉莉酸甲酯(MeJA)和枯萎病菌侵染诱导上调,在脱落酸(ABA)处理后期极显著上调表达.本研究表明MaMPK1广泛参与香蕉逆境胁迫应答.
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系统发育进化树
胁迫
顺式作用元件
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 香蕉MaMPK1基因的克隆与表达模式
来源期刊 应用与环境生物学报 学科 农学
关键词 香蕉 MAPK1 基因克隆 生物信息学分析 表达模式
年,卷(期) 2019,(4) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 985-992
页数 8页 分类号 S668.1
字数 语种 中文
DOI 10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.10027
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 程春振 34 53 4.0 6.0
2 项蕾蕾 8 2 1.0 1.0
3 孙雪丽 14 17 2.0 4.0
4 刘范 10 2 1.0 1.0
5 田娜 11 53 2.0 7.0
6 Bodjrenou Mahoudjro David 1 0 0.0 0.0
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香蕉
MAPK1
基因克隆
生物信息学分析
表达模式
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
应用与环境生物学报
双月刊
1006-687X
51-1482/Q
大16开
成都市人民南路4段9号
62-15
1995
chi
出版文献量(篇)
3881
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7
总被引数(次)
69679
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