铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析

• 作者: 兰晓天 冯磊 和凤美 田英男 胡淞
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 铁皮石斛 纤维素合成酶超级基因家族 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 49-55
• 页数: 7页
• 分类号: S567
• 字数: 3664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.08.007

摘要

纤维素合成酶超级基因家族是植物体纤维素合成的重要基因.为研究铁皮石斛纤维素合成酶和类纤维素合成酶基因(CESA/CSL)家族的功能,利用从铁皮石斛转录组中鉴定出的32个在茎中高表达量的纤维素合成酶超级基因家族成员为研究对象,使用MEGA 5.0、GSDS、SMART、TM-HMM、WoLF PSORT等软件对其构建系统进化树,并对基因结构及蛋白质保守结构域、跨膜结构和亚细胞定位等进行综合分析.结果显示,CESA/CSL基因在铁皮石斛不同组织中表达的数目和表达量均不同,具有组织表达特异性.铁皮石斛茎中表达量较高的CESA/CSL基因家族可分为6个亚族,外显子数目1～21个.CESA/CSL基因编码的蛋白质保守性较强,除CSLA亚族外,其余亚族均含有该基因家族的保守结构域Cellulose synthase.CESA/CSL蛋白主要分布于质膜上,大部分具有跨膜结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	和凤美	云南农业大学园林园艺学院	41	269	8.0	15.0
2	兰晓天	云南农业大学园林园艺学院	2	0	0.0	0.0
3	胡淞	云南农业大学园林园艺学院	1	0	0.0	0.0
4	冯磊	云南农业大学园林园艺学院	1	0	0.0	0.0
5	田英男	云南农业大学园林园艺学院	1	0	0.0	0.0