MBL2与MASPs家族蛋白质相互作用的生物信息学分析

• 作者: 吕传柱 张安强 彭磊 梁华平 程少文 陈扬平
• 来源期刊: 海南医学院学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘露糖结合凝集素2 丝氨酸蛋白酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（15）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1121-1124,1129
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4|Q51
• 字数: 1966字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13210/j.cnki.jhmu.20190808.001

摘要

目的:通过生物信息学方法对甘露糖结合凝集素2(MBL2)蛋白与甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白质的相互作用进行全面预测分析.方法:使用同源建模(Swiss-model)和折叠识别(Phyre2)分别来构建MBL2蛋白与MASPs家族蛋白质的结构,使用STRING数据库及ZDOCK3.02预测分析MBL2与MASP1、MASP2两个蛋白质的相互作用情况.结果:MBL2与MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等构成相互作用网络.MBL2与MASP1结合位点和MASP2的结合位点高度重叠.MBL2参与结合MASP1的残基,大部分(77％)也参与了与MASP2的结合,表明MBL2是通过同一个区域,分别与MASPs家族的蛋白质相互作用.结论:MBL2与MASPs家族蛋白质之间作用密切,从而可能在补体系统激活及机体免疫防御等方面发挥重要的作用.