基于转录组测序的青蟹寿锦化相关基因分析

• 作者: 万学锋 陈汉鑫 鞠玉栋
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 多肉植物 锦化突变 转录组 光合作用
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 176-183
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 4698字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2019.02.006

摘要

[目的]以青蟹寿及其全锦突变体qj为材料,研究多肉植物锦化变异分子机理.[方法]利用分光光度计法、转录组测序(RNA-seq),分别测量其叶绿素、类胡萝卜素含量及其相关基因的表达水平,并筛选差异显著的相关代谢途径.[结果]结果表明,qj的叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素的含量显著下降;对青蟹寿及qj叶片转录组测序分别获得44 988 938和37 271 576条Reads,经过滤拼接组装得到45 226条Unigene;所得Unigene的Nr注释分类中有26 999条,Swissport注释有20 279条,KOG注释有16 943条,KEGG注释有10 775条;筛选获得表达差异显著基因共20 305条,涉及130个途径,其中21个途径差异显著.筛选得到的叶绿素合成途径(ko00860)、天线蛋白(ko00196)和光合作用途径(ko00195)的基因表达对比分析,结果表明这3个途径的基因普遍显著下调表达.[结论]初步探索了多肉植物锦化变异的转录组信息,筛选到表达差异显著的基因及途径,为进一步研究多肉植物锦化变异机制提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鞠玉栋	福建省农业科学院亚热带农业研究所	52	174	7.0	10.0
2	陈汉鑫		13	38	3.0	5.0
3	万学锋		10	49	3.0	6.0