抑癌基因LHPP的生物信息学预测及在肝细胞癌中的表达分析

• 作者: 成镀 操寄望 谢鹏
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: LHPP 生物信息学 肝细胞癌
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学研究
• 页码范围: 756-761
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7|R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2019.0026

摘要

目的:利用生物信息学方法预测和分析磷酸赖氨酸磷酸组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)蛋白的结构和功能.方法:从NCBI的Gene数据库中获取LHPP基因信息及其编码蛋白序列,使用NCBI在线数据库、Expasy数据库的ProtParam和ProtScale、SignalP 4.1 Server、TMHMM Server v.2.0、PSORT Ⅱ Prediction、The Human Protein Atlas、SOPMA、SWISS-MODEL、NetPhos 3.1 Server、PhosphoSite Plus、STRING等在线数据库对LHPP蛋白的生物学特性进行预测分析.结果:人LHPP蛋白的理论分子质量为29 kU,属于酸性、稳定、疏水、非分泌型、无跨膜区蛋白,主要存在于细胞质,线粒体、细胞核和内质网也可动态存在,其主要二级结构为随机卷曲和α-螺旋,存在磷酸化、乙酰化和泛素化位点,LHPP蛋白组织表达特异性不强,且在肝癌等多种肿瘤中表达下降.LHPP蛋白主要与ATP合酶α/β家族和磷酸化酶超家族相互作用,参与调控氧化磷酸化和能量代谢等信号通路.结论:生物信息学分析LHPP蛋白在肝癌中下降,可能与其相应结构位点发生磷酸化、乙酰化或泛素化后参与调控氧化磷酸化和能量代谢信号通路相关.