去势对淮南公猪背最长肌转录组的影响

• 作者: 任巧玲 张家庆 徐照学 曹海 滑留帅 王璟 白献晓 白红杰 邢宝松 郭红霞 陈俊峰
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 淮南猪 肉质 转录组测序 肌肉发育 脂肪沉积
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1746-1758
• 页数: 13页
• 分类号: S828.2
• 字数: 8219字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.09.003

摘要

旨在分析去势对猪背最长肌基因表达的影响,探讨去势对肉质性状的分子调控机制.本研究将6头健康公猪分为两组,去势组和非去势组(对照组),在体重达到130 kg时(大约300～315日龄)采集背最长肌样品,利用Illumina HiSeq 2000高通量RNA-seq测序技术对两组猪背最长肌进行转录组测序,使用DESeq软件筛选差异表达基因,并在GO和KEGG数据库中对这些差异表达基因进行功能注释和富集分析.结果 显示,去势和非去势淮南公猪分别获得83 613 018和83 746 508条可用读段,与猪参考基因组(Sscrofa10.2)的比对率分别为73.78 ％和74.09％.与非去势组相比,去势后共有差异表达基因935个,其中上调基因503个,下调基因432个(P＜0.05且| logz (Fold Change) 7＞0.8).其中与肌肉发育相关上/下调最显著的基因分别是胶原蛋白XⅠ型α1(COL11A1)和血管紧张素Ⅱ1型受体(AGTR1),而与脂肪代谢相关上/下调最显著的基因分别是硬脂酰辅酶A去饱和酶1(SCD-1)和脂肪特异性磷脂酶A2(PLA2G16).GO和KEGG通路分析发现,两组差异表达基因显著富集于胰岛素、脂解、脂肪酸延长等脂质代谢相关通路,以及肾上腺素能、心肌收缩、磷酸腺苷活化的蛋白激酶等肌肉发育相关通路.本研究表明,去势后公猪脂肪沉积能力增强,肌肉发育改变,肉质性状随之改变.SC D-1、激素敏感脂酶(HSL)、葡萄糖转运体4(GLUT4)、丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)、促分裂原活化蛋白激酶(MEK)等12个差异表达基因能同时或部分参与激素分泌、脂肪沉积和肌肉发育的调控,这些基因与去势后肉质性状的改变显著相关,值得进行进一步的功能验证.