绵羊HADHB基因生物信息学分析及营养应激状态下的表达变化

• 作者: 张枫惠 李俊玲 杜荣 秦健 郭丽荣 韩高链
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 营养应激 HADHB基因 生物信息学分析 mRNA表达
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 94-98,162
• 页数: 6页
• 分类号: S826.2
• 字数: 3942字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2019-05-094

摘要

本研究旨在探索绵羊HADHB的分子特性以及在营养应激中的作用.根据GenBank登录的基因序列(XM_004005732.3)对HADHB基因进行一系列生物信息学分析.随机选取6只成年健康绵羊,分为正常组和禁食组.通过荧光定量PCR技术及NormFinder软件检测2个常用内参基因ACTB和GAPDH的稳定性,然后测定HADHB基因的表达.结果表明:绵羊HADHB分子式为C2273H3648N630O673524,由475个氨基酸组成,存在蛋白质跨膜区,该蛋白有91.3％位于线粒体;HADHB理论等电点(pI)为9.38,平均疏水性为-0.093,不稳定指数为34.16;HADHB基因在不同物种中保守性较高,进化树和三级结构预测结果均表明绵羊和山羊、藏羚羊、牛亲缘关系较近;荧光定量结果表明,ACTB更适合作为本实验的内参基因,禁食组绵羊HADHB基因mRNA表达量较正常组显著上升.本研究成功构建了营养缺陷应激模型,为绵羊HADHB及相关通路的进一步探索奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜荣	山西农业大学动物科技学院	24	132	6.0	11.0
2	韩高链	山西农业大学动物科技学院	4	1	1.0	1.0
3	郭丽荣	山西农业大学动物科技学院	4	1	1.0	1.0
4	李俊玲	山西农业大学动物科技学院	3	1	1.0	1.0
5	张枫惠	山西农业大学动物科技学院	4	0	0.0	0.0