莜麦AnHRGP基因的生物信息学分析

• 作者: 刘丽珍 刘建霞 刘文英 周凤 王润梅 田宏先
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 莜麦 富含羟基脯氨酸糖蛋白 生物信息学方法 基因序列 氨基酸序列 微观分析 立体结构 基因功能
• 年，卷（期）: 2019,（18）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 75-78
• 页数: 4页
• 分类号: S512.601
• 字数: 3196字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.18.015

摘要

以AnHRGP基因编码的富含羟基脯氨酸糖蛋白(AnHRGP)为研究对象,用生物信息学方法对该蛋白质的一级结构及理化性质、跨膜区、亲疏水性、二级结构及功能位点、三级结构特点等进行分析.应用ExPASy在线分析AnHRGP的氨基酸组成及理化性质,通过SOMPA在线预测AnHRGP的二级结构,应用TMHMM Server v.2.0对AnHRGP进行跨膜结构分析,采用Phyre2对蛋白质的三级结构进行建模.结果 表明,该蛋白基因的开放阅读框(openreading frame,简称ORF)可以编码202个氨基酸,是一种无信号肽、无跨膜结构、无卷曲螺旋结构、定位于叶绿体和线粒体基质空间的不溶性疏水蛋白.无规则卷曲为AnHRGP中成分最多的二级结构.通过Phyre2工具模拟出了该蛋白质的三级结构模型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田宏先	山西省农业科学院高寒区作物研究所	48	509	9.0	22.0
2	周凤	山西大同大学应用生物技术研究所	22	130	7.0	10.0
3	王润梅	山西大同大学应用生物技术研究所	32	114	7.0	9.0
4	刘建霞	山西大同大学应用生物技术研究所	30	83	5.0	7.0
5	刘文英	山西大同大学应用生物技术研究所	24	59	5.0	7.0
6	刘丽珍	山西大同大学应用生物技术研究所	6	4	1.0	2.0