长春碱生物合成途径中关键酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘晓宁 孙志强 孙淑妮 李喆 李昌宁 黄应文
• 来源期刊: 现代农业科技
• 学科: 生物学
• 关键词: 长春花 关键酶 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 林业研究
• 页码范围: 115-117,119
• 页数: 4页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3895字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5739.2019.04.062

摘要

以长春花幼苗的叶片为材料,通过RT-PCR克隆关键酶基因CDS序列,利用在线软件ExPASy ProtParam、SignalP 4.1、TMHMM V.2.0、TargetP 1.1分析蛋白理化性质、蛋白信号肽、蛋白跨膜区以及亚细胞定位,在线工具Conserved Domain、SOPMA预测蛋白保守结构域和二级结构,MEGA6.0软件构建蛋白系统进化树,为后续的TIA合成提供理论研究依据.结果表明,STR、TDC、和ORCA3关键酶基因的CDS序列大小分别为1059、1503、612 bp;生物信息学分析表明,STR、TDC、和ORCA3关键酶定位于细胞不同区室,为酸性蛋白,无信号肽,除STR外无跨膜区,由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲等二级结构组成;除TDC外均包含高度保守的结构域;聚类分析表明其与小蔓长春花、罗芙木和中果咖啡具有较高的相似性,较近的亲缘关系和遗传距离,该结果可为明确该基因在TIA合成代谢途径中的重要作用奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄应文	黄河科技学院医学院	1	0	0.0	0.0
2	孙淑妮	黄河科技学院医学院	1	0	0.0	0.0
3	李昌宁	黄河科技学院医学院	1	0	0.0	0.0
4	李喆	黄河科技学院医学院	1	0	0.0	0.0
5	孙志强	黄河科技学院医学院	1	0	0.0	0.0
6	刘晓宁	黄河科技学院医学院	13	21	3.0	4.0