大豆GmPID基因生物信息学分析及克隆

• 作者: 伍应保 吕晶晶 张勇 张惠宁 张超 张高阳 李思楠 武小霞 涂班策 满百膺 程鹏
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 再生 AGC激酶 GmPID 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 13-22
• 页数: 10页
• 分类号: S565.1
• 字数: 4847字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2020.01.002

摘要

利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树.结果表明, GmPID编码区cDNA长度为1 359 bp,编码452个氨基酸, GmPID编码的蛋白为碱性亲水性蛋白;分析其蛋白功能结构域发现,GmPID蛋白含有丝氨酸/苏氨酸激酶催化结构域,为PKc-like超家族成员;构建系统进化树发现其与密花豆亲缘较近.研究结果有利于深入研究大豆再生相关基因GmPID在大豆再生过程中的关键作用,为提高大豆再生效率提供理论基础.