油桃茎痘相关病毒中国分离物基因组的分子特征分析

• 作者: 卢美光 周俊 李世访 杨丽娟 许云霄
• 来源期刊: 植物保护学报
• 关键词: 油桃茎痘相关病毒 基因组 分子特征
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 143-149
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2020.2019126

摘要

为明确我国油桃茎痘相关病毒(nectarine stem-pitting-associated virus,NSPaV)基因组的分子特征,利用RT-PCR和RACE技术对NSPaV中国分离物NSPaV-T04基因组进行克隆,采用最大似然法对得到的NSPaV基因组序列和GenBank中的5条NSPaV基因组序列构建系统发育树,应用RDP软件对NSPaV基因组序列进行重组分析.结果 表明:中国分离物NSPaV-T04基因组序列全长为4 991 nt,包括4个开放阅读框(open reading frame,ORF),其中ORF1与ORF2共同编码1个RdRpP1-P2融合蛋白,ORF3编码1个CP,ORF5与ORF3共同编码CP通读蛋白.系统发育树和序列比较分析结果显示,中国分离物NSPaV-T04(MN095353)与美国分离物NSPaV/12P42(KT273410)的亲缘关系最近,核苷酸序列同源性最高,为96.4％;NSPaV-T04的RdRp P1变异较大,与GenBank中5条NSPaV基因组核苷酸序列的同源性为90.5％～96.1％,CP较为保守,核苷酸序列的同源性为96.6％～98.7％.重组分析结果显示,中国分离物NSPaV-T04为鉴定的一个重组体(韩国分离物SK)的亲本序列,表明中国分离物NSPaV-T04可能是一个实际的重组体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世访	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	50	364	11.0	16.0
2	卢美光	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	31	584	11.0	24.0
3	杨丽娟	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	4	2	1.0	1.0
4	许云霄	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
5	周俊	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	2	4	1.0	2.0