中华猕猴桃bZIP家族成员的比较基因组学分析

• 作者: 于丰源 张真真 牛向丽 王明雪 蒋礼玲 贾举庆 陈思佳 黄胜雄
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: bZIP 中华猕猴桃 系统进化 比较基因组学分析 基因表达模式
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 226-235
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.06032

摘要

bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子.基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZIP家族成员在J、K、L三个分组中出现了成员的缺失.中华猕猴桃bZIP家族成员的bZIP保守域主要由碱性结构域和亮氨酸拉链结构域组成,其亮氨酸拉链结构域的第4、5肽段的第7位的亮氨酸残基存在一定程度的变异.bZIP保守域之外,在中华猕猴桃的18个bZIP家族成员中,还发现包括bZIP_ C保守域在内的8种其他类型的保守域,集中分布在A、C、D和G组bZIP成员中.通过与葡萄和番茄bZIP同源基因的比较,阐明中华猕猴桃基因组的两次三倍倍增是其bZIP基因数目增加的主要原因.中华猕猴桃不同发育时期果实的转录组揭示了参与调控果实成熟的57个bZIP基因的表达水平.本研究阐明了中华猕猴桃bZIP家族成员的进化特征、保守域组成、家族成员数目扩增的主要原因,提供了涉及果实发育的优良候选基因.