石榴等陆生植物Actin1基因密码子偏向性与进化分析

• 作者: 刘翠玉 张太奎 张孟伟 王英 苑兆和 袁伟程 赵玉洁
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 石榴(Punica granatum) 陆生植物 Actin1基因 密码子使用偏好性 进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 1799-1807
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.001799

摘要

肌动蛋白Actin1基因参与构成植物细胞骨架,功能域高度保守,在植物系统演化中具有特殊作用,是重要的管家基因.本研究选取石榴等63种具有重要经济价值或生态价值的陆生植物A aim基因,分析其密码子使用偏好性和进化.研究结果表明:石榴Actin1基因有效密码子值为46.809,密码子使用偏性较弱.石榴A ctin1基因同义密码子相对使用度大于1的密码子大部分偏向于使用以G/C结尾,其偏性主要是由于自然选择压力影响.石榴等陆生植物的Actin1基因偏向使用AAC、GAU、CAG、GAG密码子,这种偏向性在陆生植物之间属于趋同进化模式,亲缘关系相近的物种对Actin1基因密码子使用模式相似.由63种陆生植物的Actin1基因密码子偏性分析证实与物种密码子偏性与其进化及亲缘关系相关.本研究通过对石榴等陆生植物A ctin1基因密码子偏向性与进化分析为Actin1基因家族的后续研究提供理论参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苑兆和		18	63	5.0	7.0
2	赵玉洁		4	3	1.0	1.0
3	张太奎		7	23	3.0	4.0
4	刘翠玉		6	12	3.0	3.0
5	王英		3	7	2.0	2.0
6	张孟伟		3	16	1.0	3.0
7	袁伟程		1	0	0.0	0.0