非吸烟女性肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测

• 作者: 付斌 刘玉仁 张杰 邢益桓 郑永先 陈平雄
• 来源期刊: 中国肿瘤生物治疗杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 非吸烟 女性 肺癌 生物信息学分析 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 801-806
• 页数: 6页
• 分类号: R734.2|R730.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3872/j.issn.1007-385x.2020.07.013

摘要

目的:对非吸烟女性肺癌潜在相关基因进行生物信息学分析及功能预测,探讨非吸烟女性肺癌患者的发病机制及预后标志物.方法:选择从GEO数据库下载非吸烟女性肺癌患者的基因芯片并用GEO2R软件筛选出差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),再利用STRING在线分析软件对DEG进行GO和KEGG分析以及蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,然后利用插件(M-CODE)对所有DEG进行可视化处理,筛选关键DEG,最后利用GEPIA及Kaplan-Meier plotter在线工具对关键DEG进行功能预测及预后分析.结果:共筛选出160个DEG,其中上调54个、下调106个;GO分析其生物学功能主要与血管形成、单个生物细胞间黏附、GTPase活性正调控和信号转导密切相关(均P<0.05).KEGG分析发现,可能主要与细胞黏附分子、白细胞迁移、紧密连接和胞吞作用相关(均P<0.05).PPI网络分析获得8个关键DEG,分别是TIE1、PECAM1、VEGFD、ICAM2、ESAM、EMCN、ROBO4和CLDN5.结论:TIE1、CLDN5、ICAM2、ESAM、VEGFD、ROBO4可能是非吸烟女性肺癌发病机制的研究靶点,PECAM1、EMCN可能是预测非吸烟女性肺癌患者病情进展及预后的标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张杰	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	78	759	14.0	24.0
2	郑永先	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	5	13	2.0	3.0
3	付斌	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	30	169	7.0	11.0
4	刘玉仁	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	6	13	2.0	3.0
5	陈平雄	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	4	8	2.0	2.0
6	邢益桓	中南大学湘雅医学院附属海口医院急诊科	4	7	1.0	2.0