银杏ERF转录因子家族的全基因组学鉴定及表达模式分析

• 作者: 唐满生 张斌
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 银杏 ERF基因家族 生物信息学 基因结构 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 519-526
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2|S792.95
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2020.05.004

摘要

以银杏基因组数据库为基础,通过序列比对,并经过鉴定筛选,共获得112个ERF转录因子家族成员,对其进行生物信息学及表达模式分析.结果显示:银杏112个ERF成员在系统进化树上分为10个亚家族;基因结构分析表明,大部分ERF家族基因结构简单,仅少量基因含有1～4个内含子;基因表达分析显示,39个ERF基因在雄蕊中表达量较高,20个基因在幼苗中表达量较高,40个基因在胚中表达量较高;部分基因在雄蕊、胚和幼苗中具有相同的表达模式,说明其可能具有类似的功能.