油桐OFP基因家族的全基因组鉴定及低温响应分析

• 作者: 刘文娟 刘美兰 吕祎馨 尚海 张琳 王静雅 米小琴
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 油桐 OFP基因家族 低温胁迫 响应分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 949-960
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2019.0616

摘要

OVATE Family Protein (OFP)蛋白是一类在非生物胁迫方面发挥着重要作用的新型植物转录调节因子,目前油桐中尚未报道.本文利用生物信息学的方法对油桐OFP基因家族成员的系统进化、基因结构、启动子元件等进行了预测和分析,并利用转录组数据和qRT-PCR技术研究了该家族成员的组织表达特性及低温响应模式.结果 表明,油桐OFP基因家族有12个成员,可划分为4类,都存在OVATE 2结构域;染色体定位发现11个成员不均匀地分布在8条染色体上,且VfOFP6和VfOFP10存在共线性关系;启动子区共含有24类顺式作用元件,其中丰度较大的主要有光响应元件、厌氧诱导元件、激素响应相关元件、低温响应元件等;组织表达特性分析结果表明在根、叶、雌花和两性花、雄花、种子中主要表达的分别是VfOFP10、VfOFP6、VfOFP7、VfOFP12和VfOFP1;在低温胁迫条件下,VfOFP7在根、叶柄、叶中都显著诱导表达,而VfOFP16的表达量则显著下调,推测VfOFP7和VfOFP16可能在油桐响应低温胁迫调控中发挥重要作用,将为下一步开展基因的功能研究和油桐的遗传改良提供参考.