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鳌肢动物Wnt基因家族的全基因组与进化分析
鳌肢动物Wnt基因家族的全基因组与进化分析
作者:
周雁
梁园
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
螯肢动物
Wnt基因家族
全基因组
进化
摘要:
Wnt蛋白是由Wnt基因家族编码的一类富含半胱氨酸的分泌性蛋白,在多种生物过程中扮演了至关重要的角色,如胚胎发育过程中细胞形态的分化,组织的再生,体细胞稳态维持以及免疫应答的调节.基于其功能的多样性和重要性,Wnt基因家族在多种后生动物中已经被广泛研究.但是,在节肢动物门中的螯肢动物中,仍然缺乏关于Wnt基因及蛋白的系统研究.在本研究中,从8种已有基因组或转录组资源的螯肢动物对Wnt基因家族进行了生物信息学鉴定和分析,共鉴定出87个Wnt基因家族成员.对Wnt蛋白序列结构的分析结果显示螯肢动物的Wnt蛋白包含高度保守的Wnt结构域、信号肽、跨膜区域或低复杂度区域;对Wnt基因在基因组上的位置分析表明螯肢动物的Wnt基因在基因组上的分布情况主要有两种模式,包括Wnt9-Wnt6-Wnt1基因簇和Wn5-Wnt7基因簇,此外还有一些在基因的方向和数量上有差异的物种特异性的分布;系统发育树的构建结果显示螯肢动物中的Wnt5,Wnt7和Wnt11亚家族有扩增现象,而Wnt3和Wnt10亚家族发生了丢失.本研究作为螯肢动物中第一个Wnt基因家族的全基因组研究,有望丰富螯肢动物基因组学的研究内容,为Wnt基因家族在节肢动物乃至后生动物中的和进化和功能的进一步研究提供有力的基础.
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文献信息
篇名
鳌肢动物Wnt基因家族的全基因组与进化分析
来源期刊
山东农业大学学报(自然科学版)
学科
生物学
关键词
螯肢动物
Wnt基因家族
全基因组
进化
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
792-796
页数
5页
分类号
Q1
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2324.2020.05.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
梁园
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周雁
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传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
螯肢动物
Wnt基因家族
全基因组
进化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山东农业大学学报(自然科学版)
主办单位:
山东农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2324
CN:
37-1132/S
开本:
大16开
出版地:
山东泰安市岱宗大街61号农业大学学报编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
3505
总下载数(次)
10
总被引数(次)
29464
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