中国人群Hedgehog通路基因与非综合征型唇腭裂的亲源效应

• 作者: 吴涛 周仁 周治波 朱洪平 李文咏 王斯悦 王梦莹 王红 石冰 郑鸿尘
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 亲源效应 非综合征型唇腭裂 HH通路基因
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 809-814
• 页数: 6页
• 分类号: R394
• 语种: 中文
• DOI: 10.19723/j.issn.1671-167X.2020.05.003

摘要

目的:探索非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)这一类常见出生缺陷的可能致病机制,在Hedgehog (HH)通路基因中(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)探索基因多态性对NSCL/P的关联关系以及亲源效应(parent-of-origin effects,PoO)对NSCL/P发病风险的影响.方法:纳入806个中国非综合征型唇腭裂核心家系,对HH通路基因(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)的83个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),并采用对数线性模型进行亲源效应分析.家系样本来自“唇腭裂基因和交互作用的国际合作研究”项目.采用Plink进行TDT检验;通过R软件中的Haplin v6.2.1软件包开展亲源效应分析.采用Bonferroni法进行多重检验校正.结果:经过质量控制,共纳入65个SNPs进行分析,Bonferroni显著性水平为7.7×10-4(0.05/65).未校正P值前,关联分析发现rs4448343与NSCL/P存在关联(P=0.023),6个单体型(rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445、rs10512249-rs4448343、rs16909865-rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445-rs12698335、rs288756-rs288758-rs1151790)与NSCL/P存在关联(P＜0.05);6个单体型(rs288765-rs1233563、rs12537550-rs11765352、rs872723-rs288765-rs1233563、rs288765-rs1233563-rs288756、rs6459952-rs12537550-rs11765352、rs12537550-rs11765352-rs6971211)具有潜在的PoO效应(P＜0.05).以上结果经过多重检验校正,均无统计学意义(P ＞7.7×10-4).结论:未发现HH通路基因多态性与NSCL/P的关联,未发现HH通路基因通过PoO效应影响NSCI/P发病风险.