钛学术
文献服务平台
学术出版新技术应用与公共服务实验室出品
首页
论文降重
免费查重
学术期刊
学术导航
任务中心
论文润色
登录
文献导航
学科分类
>
综合
工业技术
科教文艺
医药卫生
基础科学
经济财经
社会科学
农业科学
哲学政法
社会科学II
哲学与人文科学
社会科学I
经济与管理科学
工程科技I
工程科技II
医药卫生科技
信息科技
农业科技
数据库索引
>
中国科学引文数据库
工程索引(美)
日本科学技术振兴机构数据库(日)
文摘杂志(俄)
科学文摘(英)
化学文摘(美)
中国科技论文统计与引文分析数据库
中文社会科学引文索引
科学引文索引(美)
中文核心期刊
cscd
ei
jst
aj
sa
ca
cstpcd
cssci
sci
cpku
默认
篇关摘
篇名
关键词
摘要
全文
作者
作者单位
基金
分类号
搜索文章
搜索思路
钛学术文献服务平台
\
学术期刊
\
农业科学期刊
\
农业科学总论期刊
\
广东农业科学期刊
\
龙脷叶转录组分析及黄酮类生物合成相关基因的挖掘
龙脷叶转录组分析及黄酮类生物合成相关基因的挖掘
作者:
徐世强
曹阳
梅瑜
王继华
蔡时可
黄志娜
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
龙脷叶
高通量测序
单一序列
黄酮类
功能基因
摘要:
[目的]获得龙脷叶(Sauropus spatulifolius Beille)转录组学信息特征及黄酮类生物合成通路基因.[方法]采用高通量测序平台Illumina HiSeqTM 4000对龙脷叶进行转录组测序,通过Trinity软件de novo组装获得unigene,并基于序列同源性对unigene进行功能注释和代谢通路分析.[结果]测序数据经过质控后共获得88396692个高质量的reads,通过de novo组装获得46600个unigene,N50长度为1441 bp,平均长度877 bp.其中34188个(73.36%)unigene在NR、SwissProt、KOG、GO、KEGG数据库中得到注释.其中KEGG数据库注释到6902个unigene,涉及132条代谢通路.在龙脷叶中我们共鉴定到56个unigene涉及类黄酮生物合成、9个unigene参与黄酮和黄酮醇生物合成,2个unigene参与异黄酮生物合成.同时还鉴定到1256个转录因子(transcription factors,TFs)和3842个植物抗性基因(R基因).MISA分析发现46600个unigene包含3356个简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs).[结论]利用高通量测序技术和生物信息分析获得了龙脷叶的转录组信息特征,为后期开展功能基因鉴定、解析黄酮类化合物次生代谢途径及其调控机制奠定研究基础.
暂无资源
收藏
引用
分享
推荐文章
藤茶高通量转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因挖掘
藤茶
转录组
黄酮类化合物
基因挖掘
高通量测序
金线莲转录组测序及其黄酮类合成相关基因分析
金线莲
RNA-seq
Q-PCR
含量测定
黄酮类
生物合成
黄酮类衍生物的合成
丹皮酚
黄酮类衍生物
中药
丹皮
合成
半枝莲转录组高通量测序及黄酮类相关基因解析
半枝莲
转录组测序
差异表达
黄酮
生物合成
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
龙脷叶转录组分析及黄酮类生物合成相关基因的挖掘
来源期刊
广东农业科学
学科
农学
关键词
龙脷叶
高通量测序
单一序列
黄酮类
功能基因
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
作物栽培·遗传育种
研究方向
页码范围
36-44
页数
9页
分类号
S567.1+9
字数
7064字
语种
中文
DOI
10.16768/j.issn.1004-874X.2020.07.005
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(225)
共引文献
(92)
参考文献
(23)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1978(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1988(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1990(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1994(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1996(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1997(4)
参考文献(0)
二级参考文献(4)
1998(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
1999(4)
参考文献(0)
二级参考文献(4)
2000(6)
参考文献(0)
二级参考文献(6)
2001(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
2002(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
2003(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
2004(5)
参考文献(0)
二级参考文献(5)
2005(6)
参考文献(1)
二级参考文献(5)
2006(8)
参考文献(1)
二级参考文献(7)
2007(9)
参考文献(0)
二级参考文献(9)
2008(8)
参考文献(0)
二级参考文献(8)
2009(10)
参考文献(0)
二级参考文献(10)
2010(17)
参考文献(0)
二级参考文献(17)
2011(17)
参考文献(1)
二级参考文献(16)
2012(22)
参考文献(1)
二级参考文献(21)
2013(24)
参考文献(1)
二级参考文献(23)
2014(23)
参考文献(0)
二级参考文献(23)
2015(26)
参考文献(1)
二级参考文献(25)
2016(17)
参考文献(3)
二级参考文献(14)
2017(14)
参考文献(3)
二级参考文献(11)
2018(6)
参考文献(4)
二级参考文献(2)
2019(5)
参考文献(5)
二级参考文献(0)
2020(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2020(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
龙脷叶
高通量测序
单一序列
黄酮类
功能基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东农业科学
主办单位:
广东省农业科学院
华南农业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-874X
CN:
44-1267/S
开本:
大16开
出版地:
广州市五山广东省农科院内
邮发代号:
46-43
创刊时间:
1965
语种:
chi
出版文献量(篇)
14242
总下载数(次)
17
总被引数(次)
80868
期刊文献
相关文献
1.
藤茶高通量转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因挖掘
2.
金线莲转录组测序及其黄酮类合成相关基因分析
3.
黄酮类衍生物的合成
4.
半枝莲转录组高通量测序及黄酮类相关基因解析
5.
阴香叶黄酮类化合物提取工艺的研究
6.
银杏叶中黄酮类化合物的研究进展
7.
龙脷叶总游离氨基酸含量测定
8.
黄皮叶黄酮类化合物的抗氧化性研究
9.
槐米槐叶中黄酮类物质合成相关酶基因研究
10.
藜麦叶片黄酮类物质的提取及基因型差异
11.
微波辅助提取枇杷叶黄酮类化合物工艺的优化
12.
微波辅助提取黄皮叶黄酮类化合物及其种类初步鉴别
13.
狭叶柴胡中黄酮类化合物含量及其动态变化研究
14.
5-羟基黄酮类衍生物的合成
15.
产地对连翘叶中木脂素和黄酮类成分含量的影响
推荐文献
钛学术
文献服务平台
学术出版新技术应用与公共服务实验室出品
首页
论文降重
免费查重
学术期刊
学术导航
任务中心
论文润色
登录
根据相关规定,获取原文需跳转至原文服务方进行注册认证身份信息
完成下面三个步骤操作后即可获取文献,阅读后请
点击下方页面【继续获取】按钮
钛学术
文献服务平台
学术出版新技术应用与公共服务实验室出品
原文合作方
继续获取
获取文献流程
1.访问原文合作方请等待几秒系统会自动跳转至登录页,首次访问请先注册账号,填写基本信息后,点击【注册】
2.注册后进行实名认证,实名认证成功后点击【返回】
3.检查邮箱地址是否正确,若错误或未填写请填写正确邮箱地址,点击【确认支付】完成获取,文献将在1小时内发送至您的邮箱
*若已注册过原文合作方账号的用户,可跳过上述操作,直接登录后获取原文即可
点击
【获取原文】
按钮,跳转至合作网站。
首次获取需要在合作网站
进行注册。
注册并实名认证,认证后点击
【返回】按钮。
确认邮箱信息,点击
【确认支付】
, 订单将在一小时内发送至您的邮箱。
*
若已经注册过合作网站账号,请忽略第二、三步,直接登录即可。
期刊分类
期刊(年)
期刊(期)
期刊推荐
农业基础科学
农业工程
农业科学总论
农作物
农学
园艺
大学学报
林业
植物保护
水产渔业
畜牧兽医
广东农业科学2022
广东农业科学2021
广东农业科学2020
广东农业科学2019
广东农业科学2018
广东农业科学2017
广东农业科学2016
广东农业科学2015
广东农业科学2014
广东农业科学2013
广东农业科学2012
广东农业科学2011
广东农业科学2010
广东农业科学2009
广东农业科学2008
广东农业科学2007
广东农业科学2006
广东农业科学2005
广东农业科学2004
广东农业科学2003
广东农业科学2002
广东农业科学2001
广东农业科学2000
广东农业科学2020年第9期
广东农业科学2020年第8期
广东农业科学2020年第7期
广东农业科学2020年第6期
广东农业科学2020年第5期
广东农业科学2020年第4期
广东农业科学2020年第3期
广东农业科学2020年第2期
广东农业科学2020年第12期
广东农业科学2020年第11期
广东农业科学2020年第10期
广东农业科学2020年第1期
关于我们
用户协议
隐私政策
知识产权保护
期刊导航
免费查重
论文知识
钛学术官网
按字母查找期刊:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他
联系合作 广告推广: shenyukuan@paperpass.com
京ICP备2021016839号
营业执照
版物经营许可证:新出发 京零 字第 朝220126号