牛樟芝不同发育阶段菌丝体实时荧光定量PCR中内参基因的筛选

• 作者: 刘艳玲 夏舒宁 李晶 林占熺 王泽辉 陈莉
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛樟芝 内参基因 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1160-1166
• 页数: 7页
• 分类号: S567.3|R282
• 字数: 4015字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.06.013

摘要

实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)技术具有较高的敏感性、准确性和特异性,被广泛应用于基因表达分析.在基因表达分析中,选择合适的内参基因是衡量样品表达量和准确性的重要前提和保障.本研究以液体发酵7、21、35 d的牛樟芝菌丝体为样本,采用qRT-PCR技术检测牛樟芝菌丝体内Actin、TPK、Floxuridine、CAP-Gly、α-Amylase、Phosphatase、HA2-helicase、MAGT1等8个候选内参基因在3组样本中的表达水平,采用geNorm、NormFinder、BestKeeper 3个软件对其分别进行稳定性比较和评价.结果表明,geNorm软件计算得出Floxuridine、HA2-helicase、TPK、CAP-Gly在牛樟芝菌丝体中具有更高的稳定性;NormFinder软件计算得出TPK、CAP-Gly、Floxuridine、HA2-helicase在牛樟芝菌丝体中具有较高的稳定性;BestKeeper软件计算得出HA2-helicase的表达水平最好,其次是TPK和MAGT1.综合分析结果认为TPK和HA2-helicase比其他内参基因更稳定,更适合作为牛樟芝菌丝体研究的内参基因.可见,通过牛樟芝菌丝体转录组数据来筛选和挖掘稳定表达的内参基因具有可靠性、高效性和可行性,为牛樟芝菌丝体基因表达分析提供了可靠的内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林占熺	福建农林大学国家菌草工程技术研究中心	70	429	10.0	18.0
2	李晶	福建农林大学国家菌草工程技术研究中心	15	96	4.0	9.0
3	王泽辉	福建农林大学国家菌草工程技术研究中心	3	7	2.0	2.0
7	刘艳玲	福建农林大学国家菌草工程技术研究中心	3	6	1.0	2.0
8	陈莉	福建农林大学生命科学学院	5	4	1.0	2.0
9	夏舒宁	福建农林大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0