Snail基因mRNA与结肠癌患者预后的生物信息学分析

• 作者: 刘岩 张全乐 张凤梅 张志坚 李双标 李胜水 许华
• 来源期刊: 中国中西医结合外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 TCGA数据库 Snail基因 信号通路 预后
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 800-808
• 页数: 9页
• 分类号: R735.3+5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-6948.2020.05.004

摘要

目的:探讨Snail在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系.方法:应用生物信息分析工具比对TCGA数据库中Snail基因mRNA在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平;在STRING数据库中构建Snail蛋白-蛋白相互作用网络,并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集.同时,回顾性分析我院69例手术治疗的结直肠癌患者资料,根据Snail表达水平分为高、低表达组,比较两组患者总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)的差异.采用免疫组织化学法检测患者癌组织中Snail蛋白表达水平及其与患者临床病理特征的关系.结果:结直肠癌组织Snail基因mRNA表达水平明显高于癌旁组织;PDGFB基因与Snail呈正相关(r=0.624,P<0.05),SLC44A4基因与Snail呈负相关(r=–0.48,P<0.05).Snail基因在生物学过程、细胞成分和分子功能方面分别富集于组蛋白H4脱乙酰化、ESC/E(Z)复合体和NAD依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(H3-K14特异性).KEGG信号通路富集于肿瘤相关信号通路、Notch信号通路、Wnt信号通路和结直肠癌相关信号通路等.生存分析显示,Snail高表达患者的OS低于低表达患者(HR=1.6,P<0.05),而Snail高、低表达患者的DFS差异无统计学意义(P>0.05).Snail蛋白在结肠癌组织中的表达率为59.2％(41/69).Snail蛋白高表达者在肿瘤分化程度、淋巴结转移、淋巴管侵犯率、Dukes分期等方面均差于低表达者,差异有统计学意义.结论:Snail基因在结直肠癌患者癌组织中表达水平上调,并可作为结直肠癌预后不良的分子标志物.