香蕉GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 田娜 刘范 伍俊为 刘嘉鹏 李丹 付帅 黄玉吉 程春振
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 生长调控因子 果实成熟 温度胁迫 表达模式
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1821-1835
• 页数: 15页
• 分类号: S668.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20200226

摘要

[目的]生长调控因子(Growth-regulating factors,GRF)是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育和抗逆防御过程中发挥着重要作用.为揭示香蕉GFR基因等功能,对小果野蕉生长调控因子(MaGRF)基因家族进行全基因组鉴定和分析,并研究其在香蕉果实成熟和低温胁迫应答过程中的表达模式.[方法]使用生物信息学软件对MaGRFs家族成员进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析MaGRFs在自然成熟和乙烯催熟的香蕉果实成熟过程及4 ℃低温处理叶片中的表达情况.[结果]共鉴定获得可归为4个亚家族的20个MaGRF成员,其中15个成员被预测为miR-NA396的靶基因.MaGRFs启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育相关的顺式作用元件和9种转录因子家族的结合位点.转录组结果显示,MaGRF7在自然成熟的果实中高水平表达;MaGRF13在自然成熟和乙烯催熟的果实中均高表达;属于第I和第II亚家族的多个MaGRFs在果实成熟过程中差异表达显著;低温处理显著诱导MaGRF9、14、15、18和19的表达,显著抑制MaGRF2、6和13的表达.[结论]香蕉GRF家族成员较多,它们的表达大多受miR396调控.第I和第II亚家族的MaGRF成员在香蕉果实成熟和低温应答过程中发挥着重要作用.