辣椒碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析

• 作者: 黄志楠 段伟科 白雪滢 周怡 祝梦全 刘思勤 鞠佳 潘国庆
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 NAT基因家族 系统进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2132-2144
• 页数: 13页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0190

摘要

利用生物信息学手段,在辣椒'遵辣1号'中鉴定到12个碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)基因,命名为CaNAT01～CaNAT12,它们不均等的分布在7条染色体上,片段复制和串联复制是其扩增的原因.CaNATs包含多个跨膜结构域,等电点主要集中在8.39～10.15.系统进化分析发现植物中的NAT起源于D亚组基因,后经过分化,在双子叶植物中稳定存在4个亚组,C亚组基因间的核苷酸差异最小,在进化过程中最保守,CaNATs在这4个亚组均有不同分布.辣椒NAT家族基因具有明显的组织表达差异性,部分基因在根、茎以及果实发育过程中具有重要的调控作用.在低温、高温、干旱和盐胁迫下通过qRT-PCR分析发现CaNATs具有不同程度的响应,对低温和高温具有较强的响应.