苋菜AmSPL基因家族转录组鉴定及表达分析

• 作者: 刘生财 王晓 赖钟雄 赵春丽 郑友峰 陈家兰
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苋菜 转录组测序 AmSPL基因家族 生物信息学分析 表达
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 页码范围: 19-29
• 页数: 11页
• 分类号: Q943.2|S636.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2020.12.03

摘要

为明确SPL(Squamosa Promoter Binding Protein Like)在苋菜中的功能,基于'全红'苋菜转录组数据库筛选获得17个SPL家族成员,并进行生物信息学分析预测.结果 表明,17个AmSPL蛋白分别由186～777个氨基酸组成,相对分子量从20.53～88.27 ku.构建AmSPL与拟南芥(Arabidopsis thalianaL.)16个AtSPL成员系统进化树,并根据AtSPLs基因家族的分类标准将AmSPL成员分为6组.实时荧光定量PCR分析表明,在黑暗条件下,AmSPLs的表达量均高于蓝光下,推测AmSPLs的表达可能通过某种方式受到蓝光的负调控.预测分析其中的8个AmSPL可能是miR156的靶基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄		473	4127	31.0	41.0
2	刘生财		52	150	7.0	8.0
3	王晓		18	18	3.0	3.0
4	赵春丽		9	17	4.0	4.0
5	陈家兰		2	0	0.0	0.0
6	郑友峰		1	0	0.0	0.0