4个发育期香猪睾丸中piRNA簇的生物信息学分析

• 作者: 冉雪琴 牛熙 王嘉福 马鑫芮 黄世会
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 香猪 piRNA簇 睾丸 发育机制
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 141-150
• 页数: 10页
• 分类号: S828.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20200702-03

摘要

为明确piRNA簇(Piwi-interactiing RNA Clusters)在香猪睾丸发育过程中的表达规律和调节作用,本实验选择4个发育期的雄性香猪12头:断奶期(2月龄)、初情期(3月龄)、性成熟期(6月龄)和体成熟期(12月龄),构建了4个小RNA文库,经小RNA测序,研究睾丸piRNA簇的数量、分布、来源、功能以及表达规律.结果 显示:从4个发育期睾丸组织中共发现了758个piRNA簇,其中198个簇2个及2个以上发育期共表达.piRNA簇在染色体上的分布不均匀,6号、14号染色体最为密集,Y染色体上没有检测到piRNA簇.4个发育期香猪睾丸中58％以上的piRNA簇处于低丰度表达(CPM<1),转座因子(TE)衍生的piRNA簇比例随月龄增加而下降,cDNA里检测到的piRNA簇保持较高数量.对piRNA簇来源基因进行GO分析,发现主要富集于binding功能,从中发现3个piRNA簇(簇Clu-003、簇Clu-033和簇Clu-025)与精子发生相关.这些研究结果提示piRNA簇影响香猪睾丸的发育过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冉雪琴		122	584	12.0	18.0
2	王嘉福		142	801	15.0	21.0
3	牛熙		18	41	4.0	5.0
4	黄世会		6	5	2.0	2.0
5	马鑫芮		1	0	0.0	0.0