灰葡萄孢基因组果胶酶生物信息学分析

• 作者: 李培谦 杨瑾 冯宝珍
• 来源期刊: 黑龙江农业科学
• 关键词: 灰霉病 多聚半乳糖醛酸酶 果胶酯酶 果胶裂解酶 基因组
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生物技术
• 页码范围: 17-22
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11942/j.issn1002-2767.2021.02.0017

摘要

为有效防控果蔬灰霉病,本研究采用生物信息学方法对灰葡萄孢基因组内果胶酶的分布情况、理化性质及三级结构进行了分析.结果表明:灰葡萄孢基因组内检索出6条PG氨基酸序列,4条PME蛋白氨基酸序列和4个PEL家族蛋白.BcPG1～BcPG16蛋白序列长度为370～514 aa,信号肽长度在16～22 aa,磷酸化位点丰富;BcPME1～BcPME14蛋白序列长度为327～348 aa,信号肽长度在18～23 aa,都不存在N-糖基化位点,磷酸化位点多;BcPEL1～BcPEL4蛋白序列长度为236～353 aa,信号肽长度在17～20 aa,存在多个O-糖基化位点,磷酸化位点多.3种果胶酶氨基酸序列分别存在保守区域,三级结构预测结果显示同一家族存在相似结构域,进化分析表明灰葡萄孢中的3种果胶酶具有保守性.