基于生物信息学刻画ⅡB期胰腺癌的免疫微环境特征和预后的差异

• 作者: 贾雷 于新颖 徐丽娟 徐有青
• 来源期刊: 消化肿瘤杂志（电子版）
• 关键词: 胰腺癌 生物信息学 免疫微环境 预后
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 论著|Original Articles
• 页码范围: 114-119
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7402.2021.02.006

摘要

目的 探索ⅡB期胰腺癌的免疫微环境特征,为胰腺癌的免疫治疗和预后预测提供理论依据.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TTGA)和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus database,GEO)中下载ⅡB期胰腺癌患者的转录组数据,并通过R分析,鉴别免疫亚型及不同亚型的免疫反应、差异表达基因、免疫细胞和免疫调节分子的相互作用以及其对预后的影响.使用免疫细胞和检查点基因风险评分来评估ⅡB期胰腺癌患者的预后,并通过独立数据集进行验证.结果 鉴别出3种免疫亚型(M1～M3),表现出不同的免疫反应,代表3种不同的免疫微环境.3种免疫亚型在特异性免疫特性上有显著差异,并鉴定出在M2亚型(预后最差的亚型)中显著差异表达的12个基因.此外,M1亚型(预后最好的亚型)和M2亚型免疫细胞与检查点基因的相互作用不同,M1亚型的相互作用系数高于M2亚型.其中CD47、ICOS和LAG3处于相互作用网络中心,在不同免疫亚型中的相互作用强度不同.结论 免疫细胞与检查点基因作用紊乱可以导致免疫微环境的改变,进而影响胰腺癌患者的预后.