鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的生物信息学分析

• 作者: 高婧华 陈晓文 陈越 吴利先
• 来源期刊: 中国病原生物学杂志
• 关键词: 鸟分枝杆菌 结构 功能 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 论著|ORIGINAL ARTICLES
• 页码范围: 150-154
• 页数: 5页
• 分类号: R378.911
• 语种: 中文
• DOI: 10.13350/j.cjpb.210205

摘要

目的 应用生物信息学分析软件预测鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的结构和功能. 方法 利用在线uniprot蛋白数据库、ProtParam蛋白分析网站、在线Protcale、TMHMM(TMHMM Server V 2.0)和SignalP 5.0、Softberry和PSORTⅡServer,以及SOPMA和SWISS-MODEL等生物信息学预测软件对MAV-2052蛋白的理化性质、疏水性分析、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及二级结构进行分析预测并对其三级结构进行模型构建;登录网站http://www.cbs.dtu.dk/services/netrhos/对蛋白磷酸化位点进行预测,运用uniprot蛋白数据库的Blast工具对氨基酸进行比对,采用MEGA-X软件构建进化树. 结果 MAV-2052基因全长933 bp,编码310个氨基酸的蛋白质.该蛋白与鸟分枝杆菌亚型起源于同一物种,与结核分枝杆菌的半胱氨酸合酶k1同源性较高.MAV-2052为稳定的疏水性蛋白,无跨膜区、无信号肽;预测该蛋白皿细胞定位在细胞质中,蛋白序列中存在13个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主且有两个结构域;三级结构模型显示该蛋白可形成同源二聚体,但无其他配体结合空间位置.MAV-2052蛋白为半胱氨酸合酶,属于半胱氨酸合酶/半胱氨酸β合成酶家族,是调控鸟分枝杆菌生长中的重要蛋白之一. 结论 生物信息学预测鸟分枝杆菌MAV-2052为半胱氨酸合成酶,是调控细菌生长的重要蛋白,可为鸟分枝杆菌的靶向治疗提供新思路.