LncRNA与疾病关系的知识图谱构建

• 作者: 龚乐君 杨璐 高志宏 李华康
• 来源期刊: 山东大学学报（工学版）
• 关键词: LncRNA 知识表示 LncRNA-疾病关联 知识图谱 本体
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 机器学习与数据挖掘|Machine Learning&Data Mining
• 页码范围: 26-33
• 页数: 8页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.6040/j.issn.1672-3961.0.2020.212

摘要

基于长链非编码核糖核酸(long non-coding RNA,LncRNA)和疾病关系的分析,对LncRNA和疾病知识概念建模,提出一种有效的LncRNA与疾病关系的知识图谱构建方法.使用Protégé构建本体结构,建构概念层,整合结构化与非结构化两种不同来源的数据形成数据层,通过资源描述框架(resource description frame,RDF)/网络本体语言(web ontology language,OWL)技术对数据及相应的关系进行描述,采用基于前向推理的产生式规则进行相应的知识推理,通过SPARQL查询语言和可视化技术展示知识查询的推理效果.这一研究将为LncRNA与疾病的关系研究提供参考,推动该领域的发展.