基于表型性状及SNP标记的豆瓣菜种质资源遗传多样性分析

• 作者: 季群 李双梅 朱红莲 柯卫东
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 豆瓣菜 种质资源 表型性状 SNP标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 64-71
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19928/j.cnki.1000-6346.2021.2002

摘要

对保存在国家种质武汉水生蔬菜资源圃内来自国内外不同地区的19份豆瓣菜种质资源的8个农艺性状进行调查分析,并利用SLAF-seq技术对豆瓣菜种质资源进行简化基因组测序,研究其遗传多样性.结果 表明:质量性状(叶色、茎色、顶端小叶形状)变异不明显;数量性状(顶端小叶长、顶端小叶宽、株高、茎粗、叶柄长)变异系数较低(7.69％～16.45％),说明数量性状的变异范围较窄,但仍存在具有优良性状的资源,如仰光-2豆瓣菜、大庙场野生豆瓣菜和玉龙雪山豆瓣菜,可用于品种选育.利用SLAF-seq测序技术进行测序,共获得49.21 Mb的读长数据,355141个高质量的SLAF标签,33386个多态性SLAF标签,从33386个多态性SLAF标签上共开发获得102704个高质量SNP标记.基于豆瓣菜资源8个表型性状的聚类分析,将19份豆瓣菜种质资源划分为2类,与基于SNP的聚类分析结果相类似,群体结构分析以及PCA分析均将19份资源全部分为一组,说明19份资源虽然表型上存在变异,但遗传基础狭窄,遗传多样性不高.地方品种和野生资源的遗传多样性指数π值分别为0.0121和0.0122,且地方品种和野生资源之间的遗传分化指数Fst为0.0302,群体间遗传分化较小,表明豆瓣菜地方品种与野生资源属于同一组.结果说明在我国野外地区发现的大面积疑似野生豆瓣菜可能不是野生资源,而是由栽培品种逃逸形成,所有资源很可能来源于同一个栽培类型.