柑桔叶斑驳病毒江西分离物全基因组序列测定与分析

• 作者: 丁敏 王莹 钟家美 黄爱军
• 来源期刊: 中国南方果树
• 关键词: 柑桔叶斑驳病毒 全基因组 系统发育 江西
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 13-16,22
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13938/j.issn.1007-1431.20200567

摘要

利用RT-PCR和RACE技术,从来自江西省万安县的纽荷尔脐橙叶片样品中获得了柑桔叶斑驳病毒(Citrus leaf blotchvirus,CLBV)江西分离物CLBV-JX的全基因组序列,并对CLBV-JX与其他寄主来源CLBV分离物的序列进行了一致性和系统发育分析.结果 表明,CLBV-JX全长8747 nt,编码3个开放阅读框;CLBV-JX与其他来源于柑桔的CLBV分离物的序列一致度高,基因组核苷酸一致度为96.8％～97.2％;CLBV-JX与来源于甜樱桃和猕猴桃的CLBV分离物序列一致性低,基因组核苷酸一致度分别为79.1％和74.3％;在基因组序列系统进化树上,CLBV-JX与所有柑桔来源的CLBV分离物聚为一支、亲缘关系较近,与其他寄主来源的CLBV分离物亲缘关系较远.推测CLBV的遗传分化可能与寄主存在相关性.