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基于网络药理学联合GEO芯片分析百合乌药汤治疗胃癌的分子靶点及作用机制
基于网络药理学联合GEO芯片分析百合乌药汤治疗胃癌的分子靶点及作用机制
作者:
任雪童
狄紫蕊
付冰倩
张哲
杜艳茹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
胃癌
百合乌药汤
网络药理学
生物信息学
分子机制
信号通路
摘要:
目的:基于网络药理学联合GEO芯片差异基因分析的方法,分析百合乌药汤治疗胃癌的分子靶点和作用机制.方法:在TCMSP数据库检索中药药物信息,获得百合乌药汤的活性成分和分子靶点.在GEO芯片数据库通过检索“gastric cancer”分析筛选后获得GSE118916芯片数据,通过R软件分析得出差异基因,并绘制热图和火山图.通过Cytoscape3.7.2构建百合乌药汤与胃癌的成分-靶点网络图,使用插件Bisogenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,并进行药物与疾病基因的GO富集分析(BP、CC、MF)和KEGG富集分析.结果:从GEO数据库下载分析得到与胃癌上调和下调最明显的差异基因40个.获得百合乌药汤有效活性成分10个,主要包括槲皮素(quercetin)、谷固醇(beta-sitosterol)、异松脂酸(Isopimaric acid)等,作用于PTGS2、ADH1C、ADRB2、PLAU、MAOA、CHRM3、CCNA2、MMP9、IL6等31个基因靶点.生物功能和通路富集分析表明,百合乌药汤治疗胃癌主要涉及脂多糖、氧化应激、血红素结合、蛋白激酶调节等方面,通过调节AGE-RAGE、TNF、NF-κB、IL17等信号通路发挥治疗作用.结论:百合乌药汤治疗胃癌的重要活性成分为槲皮素、谷固醇等,涉及TNF、NF-κB、IL17等信号通路.
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基于网络药理学联合GEO芯片分析百合乌药汤治疗胃癌的分子靶点及作用机制
来源期刊
中医药导报
学科
关键词
胃癌
百合乌药汤
网络药理学
生物信息学
分子机制
信号通路
年,卷(期)
2021,(3)
所属期刊栏目
分析
研究方向
页码范围
125-130
页数
6页
分类号
R285.5
字数
语种
中文
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中医药导报
主办单位:
湖南省中医药学会
湖南省中医管理局
出版周期:
半月刊
ISSN:
1672-951X
CN:
43-1446/R
开本:
大16开
出版地:
湖南省长沙市湘雅路325号湖南省卫生厅
邮发代号:
42-144
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
15371
总下载数(次)
25
总被引数(次)
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