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罗布麻CesA基因家族的生物信息学分析
罗布麻CesA基因家族的生物信息学分析
作者:
解盛
李国旗
宋立肖
谢博勋
王雅芳
刘星
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
罗布麻
纤维发育
生物信息学分析
CesA基因家族
生长发育
摘要:
植物体中纤维素是细胞壁形成的主要成分,不仅参与细胞形态的建成,调控细胞发育,还参与细胞内多种细胞信号转导途径,进而影响植物体的生长发育.纤维素合酶是植物体合成纤维素的主要酶类.为了探究CesA基因家族对罗布麻生长发育及纤维素合成的调控机理,该文通过生物信息学分析方法,从基因家族鉴定、结构分析、蛋白理化性质与多级结构预测、亚细胞定位、信号肽、进化关系和顺式作用元件等方面,对罗布麻CesA基因家族进行系统鉴定和分子特征分析.结果表明:基于全基因组测序,罗布麻CesA基因家族鉴定含有15个成员,分布在罗布麻11条染色体中的8条上,其编码蛋白的氨基酸数量为730~1158,相对分子质量81280.81~130123.18 kDa,理论等电点6.18~8.83.除了AvCesA3、AvCesA5、AvCesA7、AvCesA10和AvCesA11蛋白为稳定蛋白,其余成员均为不稳定蛋白;除了AvCesA12蛋白为疏水性蛋白,其余成员均为亲水性蛋白.该家族成员包含3~14个外显子,8~15个保守基序.编码蛋白主要分布于质膜与高尔基体上,无信号肽,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主要构成元件.AvCesA15蛋白的跨膜结构域和三级结构与其他成员存在显著不同.罗布麻CesA基因进化时主要受纯化选择作用.对上游1500 bp区域顺式作用元件分析,结果显示罗布麻CesA基因受到光、温度、水分、氧气等环境因子及生长素、赤霉素、脱落酸、乙烯、水杨酸等植物激素调控.该研究为进一步探究罗布麻CesA基因家族的生物学功能、提高纤维品质与品种改良奠定理论基础.
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篇名
罗布麻CesA基因家族的生物信息学分析
来源期刊
广西植物
学科
关键词
罗布麻
纤维发育
生物信息学分析
CesA基因家族
生长发育
年,卷(期)
2021,(4)
所属期刊栏目
生理与分子生物学|Physiology and Molecular Biology
研究方向
页码范围
522-534
页数
13页
分类号
Q943
字数
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw202008006
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期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
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