中国蓝舌病病毒血清15型毒株的全基因组测序与进化分析

• 作者: 李占鸿 杨振兴 朱建波 肖雷 李乐 廖德芳 李华春 杨恒
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 关键词: 蓝舌病病毒血清15型 全基因组测序 系统进化分析 地域型
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学|Animal Science
• 页码范围: 446-455
• 页数: 10页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202005051

摘要

[目的]获取中国蓝舌病病毒血清15型(BTV-15)毒株的全基因组序列并分析其遗传特征.[方法]通过全长cDNA扩增与高通量测序技术获取中国1996年分离的BTV-15型毒株B105/YN/1996的全基因组序列,进行序列比对并构建系统发生树.[结果]序列分析结果显示:B105/YN/1996毒株基因组全长19 154 bp,各基因节段长度在822 bp(Seg-10)～3 944 bp(Seg-1)之间,编码蛋白大小在216(NS3a蛋白)～1 302(VP1蛋白)个氨基酸残基之间.B105/YN/1996毒株的Seg-1、-2、-3、-4、-6与澳大利亚2012年分离BTV-15型毒株的对应基因节段之间具有最近的亲缘关系,Seg-7、-8、-9、-10则与中国BTV-15型V447毒株、BTV-4型YTS4毒株和BTV-1型Y863毒株的序列相似度最高;Seg-5与印度BTV-1型毒株IND1992/02具有最近的亲缘关系.在构建的系统发生树上,B105/YN/1996毒株的Seg-2与Seg-6归属于东方型,Seg-3与Seg-4则构成独立远东型;Seg-7、-10分别构成独立东方-1与东方-2型.[结论]中国BTV-15型毒株B105/YN/1996的不同基因节段在遗传进化上呈现高度多样性的特点,提示该毒株为基因重配毒株;该毒株的Seg-3、-4、-7、-10形成了独特的地域型,提示中国BTV-15型毒株在进化上的特殊性.