广藿香青枯病菌致病相关基因RsgidA的克隆及生物信息学分析

• 作者: 李巧 王亚琴 贺红 张泳 张宇瑶 黎广卫
• 来源期刊: 中草药
• 关键词: 广藿香 青枯菌 RsgidA基因 克隆:生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 药材与资源|Medicinal Materials
• 页码范围: 3068-3074
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2021.10.024

摘要

目的 对广藿香青枯菌菌株PRS-84的致病相关基因RsgidA进行克隆及生物信息学分析.方法 以广藿香青枯病菌Tn5转座子插入的低致病力突变株PRS-84-4-7为材料,对广藿香进行致病性实验;以Tn5转座子序列为基础,对突变株PRS-84-4-7的基因组进行反向PCR扩增,克隆转座子插入位点的侧翼序列;根据序列的同源基因设计特异性引物,对野生菌株PRS-84的基因组进行PCR扩增,对克隆获得的目标基因序列进行生物信息学分析.结果 低致病力突变株PRS-84-4-7对广藿香的致病性不明显.成功获得了低致病力突变株转座子插入位点的侧翼序列,该序列与gidA基因的相似度最高,将插入位点基因命名为广藿香青枯病菌RsgidA基因.从野生菌株PRS-84中克隆了致病相关基因RsgidA,全长1881 bp,编码626个氨基酸.系统进化分析显示,RsgidA基因编码蛋白与植物病原中丁香假单胞菌Pseudomonas syringae的GidA蛋白亲缘关系较近.结论 从广藿香青枯病菌菌株PRS-84中成功克隆了致病相关基因RsgidA,为了解青枯病菌的致病机制、研究新的防治广藿香青枯病的方法奠定了基础.