与蒙古冰草抗旱相关的NAC转录因子生物信息学及其表达分析

• 作者: 范菠菠 张学峰 于卓 赵彦 马艳红
• 来源期刊: 草地学报
• 关键词: 蒙古冰草 NAC基因家族 抗旱 实时荧光定量
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1183-1192
• 页数: 10页
• 分类号: S543+.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2021.06.007

摘要

NAC转录因子具有调控植物生长发育及应对非生物逆境胁迫等多种功能.为筛选蒙古冰草(A gropyron mongolicum Keng)抗旱相关的NAC转录因子,本研究基于转录组测序数据,利用生物信息学方法对蒙古冰草NAC转录因子的结构、理化性质、进化关系和保守性等进行分析,同时运用实时荧光定量技术对抗旱相关的2个NAC基因进行差异表达分析.结果表明:筛选出26个蒙古冰草NAC家族成员,其中15个具有完整NAC转录因子结构域,其均属于亲水性蛋白,大部分定位于细胞核;15个蒙古冰草NAC转录因子的蛋白磷酸化位点均含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸.进化关系比对显示AmNAC100和AmNAC102-2转录因子与已知有抗旱功能的NAC蛋白同源性极高,其二、三级结构主要以无规则卷曲为主,motif1,2,3,8为其共有的保守基序,多序列比对将保守结构域划分为子域A—E.差异表达分析发现AmNAC100和AmNAC102-2基因相对表达量均高于对照(CK),在蒙古冰草干旱胁迫中起正调控作用.