实时定量PCR评估金针菇的内参基因稳定性

• 作者: 贾定洪 王波
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 实时定量PCR 金针菇 稳定性 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research papers
• 页码范围: 1700-1711
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.200394

摘要

金针菇在中国和日本是最受人喜爱的食用菌之一,在重要栽培食用菌中产销量排名第四.近年来,已在活性物质、分子标记及基因鉴定方面开展了大量工作,但未见有金针菇内参基因稳定性研究的报道,导致金针菇基因表达研究无内源参考基因稳定性数据作为参考.本研究采用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种软件评估18S核糖体RNA(18S)、28S核糖体RNA(28S)、60S核糖体蛋白L18(Rpl18)、肌动蛋白1(Act1)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(Gapdh)、翻译延伸因子EF1-alpha(Ef1A)、DNA指导的RNA聚合酶亚基2(Rpb2)、细胞色素C氧化酶亚基1(Cox1)及细胞色素b(CytB)等9个内参基因的稳定性.综合分析结果显示,单个基因中Act1基因最稳定,CytB表达稳定性最差,但单个候选内参基因的稳定性不能够满足定量PCR实验要求;根据geNorm软件分析结果,CytB和Rpb2是金针菇定量PCR的稳定内参基因组合.本研究首次评估了金针菇的内参基因稳定性,将为后续的基因表达研究提供参考.