基于重映射的SPRI视频自动找点方法

• 作者: 袁彬峰 汪之又 黄彩霞 罗宇
• 来源期刊: 计算机技术与发展
• 关键词: 表面等离子共振成像 图像处理 重映射 蛋白质微阵列 嵌入式
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 图形与图像
• 页码范围: 33-38
• 页数: 6页
• 分类号: TP751.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2021.08.006

摘要

表面等离子共振成像(SPRI)是一种高灵敏度,高通量的,可用于实时分析生物蛋白间的相互作用的新技术.由于高通量,不需要额外标记等优点,该技术广泛应用于药物筛选、食品检测、环境监测等领域.实现SPRI视频自动化分析的关键是自动定位SPRI视频图像中的蛋白阵列,为解决该问题提出了基于重映射的SPRI视频自动找点的算法.算法需要输入生物芯片的打印效果图和SPRI视频图像,处理过程分为六个部分:截取,边缘检测,椭圆拟合,阵列识别,坐标映射和自动校准,输出SPRI视频中蛋白点阵列的坐标矩阵.算法基于将打印效果图中的蛋白点坐标重映射为SPRI视频中蛋白点坐标思路实现.实验结果表明,该算法能准确定位SPRI视频中的蛋白阵列,不受蛋白点的阵列模式和SPRI视频中噪音的影响.并且算法定位SPRI视频中蛋白阵列耗时短,支持在嵌入式设备上实时分析SPRI视频.