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摘要:
目的:探讨CXCL趋化因子家族作为肝癌治疗与预后标志物的价值.方法:检索UNIPROT、ONCOMINE、TCGA、GEPIA、TIMER数据库,分析肝癌中异常表达的CXCL因子类型.在KMPLOT网站分析CXCL与肝癌患者不良预后的相关性.使用R语言绘制热图并计算CXCL家族与上皮间质转化(EMT)、免疫因子浸润的相关性.结果:CXCL6、CXCL8、CXCL9、CXCL10在肝癌组织中显著高表达,CXCL2、CXCL12、CXCL14在肝癌中显著低表达.高转录水平CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL12、低转录水平CXCL6的肝癌患者有更长的生存期.CXCL8与肝癌EMT关系最为密切.CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL14、CXCL16、CXCL17与常见的6种免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润相关.结论:CXCL家族在肝癌组织中具有显著的差异表达,并与肝癌细胞的转移、免疫细胞浸润、预后相关,可作为肝癌临床治疗与预后的潜在标记物.
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文献信息
篇名 CXCL家族作为肝癌微环境预后与治疗标志物的生物信息学分析
来源期刊 暨南大学学报(自然科学与医学版) 学科 医学
关键词 肝癌 肿瘤标志物 免疫治疗 生物信息学分析 趋化因子
年,卷(期) 2022,(1) 所属期刊栏目 基础医学
研究方向 页码范围 29-42
页数 14页 分类号 R735.7
字数 语种 中文
DOI 10.11778/j.jdxb.2022.01.004
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肿瘤标志物
免疫治疗
生物信息学分析
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研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
暨南大学学报(自然科学与医学版)
双月刊
1000-9965
44-1282/N
16开
广州市石牌暨南大学
1936
chi
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3168
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