黄皮转录组测序及抗氧化相关基因的挖掘

• 作者: 刘照宇 刘新婷 白新宇 李雯 曾教科
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 黄皮 抗氧化 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 生物工程|Bioengineering
• 页码范围: 199-209
• 页数: 11页
• 分类号: TS255.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20201110-105

摘要

为从分子水平研究黄皮果实抗氧化酶抑制褐变的机理,以热激(heat treatment,HT)、程序降温(low temperature conditioning,LTC)和对照(CK)组处理后3℃贮藏的黄皮果实为材料,研究温度对黄皮果实褐变及抗氧化效果的影响,并应用转录组测序技术对黄皮果实RNA进行测序分析.结果 表明:与CK相比,HT和LTC处理均可有效延缓黄皮果实采后褐变与失水,维持贮藏中后期较高的超氧化物歧化酶、过氧化物酶和过氧化氢酶等抗氧化酶活性,同时保持较高的1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基清除能力;贮藏第6天开始,LTC处理对黄皮果实的抗氧化效果显著提高.转录组测序共35421个转录本;HT第6天和CK第6天相比筛选出1631个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),LTC第6天和CK第6天相比筛选出5404个DEGs;基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析表明,此类DEGs主要集中于植物激素信号转导途径、苯丙素生物合成和黄酮类化合物的生物合成途径等,这些途径均与植物的抗氧化/抗褐变相关.从已获得的DEGs中筛选得出HT和LTC处理可能通过诱导第Ⅳ类、Ⅴ类和Ⅹ类抗氧化基因的表达,从而延缓黄皮果实褐变发生.研究结果为黄皮抗氧化相关基因挖掘和褐变调控提供理论数据支撑.