中国瘰螈皮肤转录组测序及活性多肽分析

• 作者: 唐兴 梁广男 刘雅莉 段志贵
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国瘰螈 转录组测序 活性多肽 cDNA文库 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学|Animal Science and Animal Medicine
• 页码范围: 69-75
• 页数: 7页
• 分类号: S865.4|Q516
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20220325.005

摘要

首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽.提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建cDNA文库,采用Illumina HiSeq 4000进行测序.测序数据处理后获得unigene,并对其进行基因注释和生物信息学分析.共组装获得了 74 371个非冗余unigene(平均长度为762bp),其中33 627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释,5 137个unigene的注释结果来自两栖类物种,约占注释总数的15％.另外,从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素,它们大多数具有皮肤免疫或防御功能,且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽.结果为阐明蝾螈皮肤免疫或防御机制提供了前期基础资料.