X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系 TRAPPC2基因新无义突变的鉴定及分析

• 作者: 张闻宇 康可 张玉薇 侯巧芳 秦利涛 刘红彦 郝冰涛 杨科 廖世秀 娄桂予
• 来源期刊: 中华骨科杂志
• 关键词: 骨骺 蛋白质基因组学 密码子，无义
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 313-319
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn121113-20210726-00479

摘要

目的:对一个疑似X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良（spondyloepiphyseal dysplasia tarda，SEDT）的家系进行临床特征分析和致病基因的筛查，并对可疑变异进行分析，为遗传咨询和产前诊断提供实验依据。方法:采集家系成员病史，一般体检，关节、脊椎X线片检查；收集该家系成员外周血样，提取样本DNA，采用靶向基因高通量测序方法对先证者DNA全外显子进行测序，并对测序数据进行分析；针对可疑突变，采用PCR和Sanger测序对家系其他成员DNA样本进行验证；提取家系成员外周血淋巴细胞的RNA，RT-PCR扩增致病基因外显子3、4区域，琼脂糖凝胶鉴定扩增片段大小；并采用qPCR检测致病基因的表达。结果:根据家系中患者临床表型和脊椎X线片特征，将该家系患者诊断为X-连锁隐性遗传SEDT。全外显子测序检测到先证者转运蛋白复合体亚单位2（trafficking protein particle complex subunit 2， TRAPPC2）基因NM_001011658：c.91A>T（p.K31*）无义突变，其表弟该基因位点也存在相同变异，家系其他无表型成员未检出该变异。患者外周血淋巴细胞RT-PCR结果与家系正常对照的扩增片段相同，表明该变异不影响转录本的剪接。qPCR结果显示，家系患者 TRAPPC2的转录水平表达较家系正常对照及正常人对照显著降低。 结论:发现 TRAPPC2基因c.91A>T新无义变异，该变异可以导致 TRAPPC2功能丧失，是本家系的致病性变异。