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甘草Pht1基因家族鉴定与表达分析
甘草Pht1基因家族鉴定与表达分析
作者:
张亚丽
王楠
高静
张岗
李铂
颜永刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘草
磷转运蛋白
非生物胁迫
基因表达
基因克隆
摘要:
Pht1家族磷酸盐(Pi)转运体介导植物中磷(P)的吸收和再动员.为探讨甘草Pht1基因的结构及表达模式,该研究利用生物信息学方法对甘草Pht1(GuPht1)基因家族进行分析,结合转录组数据和实时荧光定量(qRT-PCR)分析GuPht1在非生物胁迫下的表达,并采用RT-PCR克隆4个GuPht1基因.结果显示:(1)甘草中有8个Pht1家族成员(GuPht1;1—GuPht1;8),都位于细胞膜上,且具有12个跨膜结构,属于MFS超家族,氨基酸长度介于521~570 aa之间,含有Pht1保守的特征序列GGDYPLSATIMSE.(2)系统进化分析显示,甘草GuPht1基因家族成员与豆科植物亲缘关系较近;启动子区含有与磷饥饿有关的W-box、G-box、PHO-like和P1BS元件;甘草GuPht1基因家族在Scaffold定位分布均匀,三级结构均为单体.(3)转录组数据分析显示,GuPht 1响应干旱、盐、激素等胁迫,且表达有组织特异性.qRT-PCR结果表明,低磷胁迫下GuPht1基因有明显的时空表达差异性,Gu-Pht1;1/1;6/1;8在根中表达明显上调,GuPht1;5/1;6在叶中表达明显上调,低磷处理显著提高了GuPht1在根和叶中的表达量,根中被诱导上调表达的成员更多;在干旱、盐、激素处理下根和叶中GuPht1;5都被显著诱导表达.(4)成功克隆甘草 GuPht1;1/1;2/1;4/1;5基因,长度分别为 1 562、1 618、1 625和 1 616 bp,编码522、538、540和537个氨基酸.本研究结果为深入探讨Pht1家族的功能和甘草对营养胁迫的响应机理提供参考.
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文献信息
篇名
甘草Pht1基因家族鉴定与表达分析
来源期刊
西北植物学报
学科
农学
关键词
甘草
磷转运蛋白
非生物胁迫
基因表达
基因克隆
年,卷(期)
2022,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
229-241
页数
13页
分类号
Q319+.3|Q785|S567
字数
语种
中文
DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2022.02.0229
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
节点文献
引证文献
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同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
甘草
磷转运蛋白
非生物胁迫
基因表达
基因克隆
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
主办单位:
西北农林科技大学
陕西省植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4025
CN:
61-1091/Q
开本:
大16开
出版地:
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
邮发代号:
52-73
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7739
总下载数(次)
9
总被引数(次)
145271
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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