肺腺癌关键基因的鉴别及预后

• 作者: 黄河 李成长 彭燕 姜洪波
• 来源期刊: 中国老年学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 关键基因 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 肿瘤
• 页码范围: 33-37
• 页数: 5页
• 分类号: R563
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9202.2022.01.010

摘要

目的 利用生物信息学方法对肺腺癌基因表达谱进行研究,筛选出该病发生相关的关键基因.方法 通过对GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中肺腺癌患者基因芯片数据的检索获取基因表达数据,利用美国国立卫生研究院提供的GEO2R基因差异表达在线分析工具进行数据分析,然后对差异基因进行GO和KEGG富集分析,利于STRING数据库构建蛋白互作网络,将蛋白互作数据导入到Cytoscape软件,然后基于MCC算法选取排名前十的基因,也就是关键基因,对关键基因进行生存分析确定其预后价值.结果 共得到出855个差异基因,其中558个为下调基因,297个为上调基因.MCC算法所选取的关键基因分别是CCNB1、BUB1B、AURKA、BIRC5、TPX2、PRC1、BUB1、MAD2L1、CENPF和CDKN3,生存分析表明这些关键基因高表达的患者其生存时间显著减少.结论 利用生物信息学方法可以有效选取肺腺癌发病的关键基因,这些基因的高表达与患者生存时间明显相关,这些关键基因的发现将为肺腺癌治疗药物的开发提供新的重要分子靶标.