萝卜TALE转录因子家族的鉴定与分析

• 作者: 赵伟 李锡香 王海平 贾会霞 宋江萍 阳文龙 张晓辉
• 来源期刊: 生物工程学报
• 关键词: 萝卜 TALE基因家族 基因结构 进化分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术|Agricultural Biotechnology
• 页码范围: 343-358
• 页数: 16页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13345/j.cjb.210321

摘要

TALE (three-amino acid loop extension)转录因子在植物生长发育及细胞分化过程中起重要作用.在多种植物中均已鉴定出TALE转录因子的家族成员,但是萝卜TALE转录因子家族的研究鲜有报道.文中通过生物信息学手段在象牙白萝卜全基因组中鉴定出了分布于9条染色体上的33个TALE家族基因.研究结果显示,该家族中除与拟南芥KNATM同源的基因Rsa10037940外,其余基因均含有编码HOX保守结构域的序列.这些基因含有4-6个外显子.萝卜的33个TALE基因与拟南芥中的17个同源基因存在共线性关系.33个TALE基因启动子区的顺式元件中包含大量逆境响应元件.表达特性分析显示,该基因家族BELL亚家族内有4个基因在根内表达量较高,KNOX亚家族内有2个基因在薹和愈伤中表达量较高.该家族不同亚型成员之间的蛋白3D结构高度相似.编码蛋白均为弱酸、有亲水性.萝卜TALE基因家族在进化上较为保守,分化上与拟南芥存在一致性,与水稻差异较大.本研究为开展萝卜中TALE转录因子的生物学功能研究提供了重要参考.