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摘要:
以碱基成分偏移量D值[1]为基本参数定义参数d,以d为Yeast编码区的特征参数,对Yeast的第1、2、3类ORF(open reading frame)进行了统计,得到d的特征参数区间.并且,以此区间为标准对Yeast的6类ORF,以及5′帽、3′尾、内含子、组分随机序列等非编码序列进行了检验.结果表明,用d作编码区的特征参数是可行的,它可以很好地区分编码序列和非编码序列.另外,又讨论了参数d与基因表达水平(用CAI值来衡量)的关系.发现,参数d与基因表达水平成很好的正相关关系;发现密码子的第1位点和第2位点的某些碱基分布与基因表达水平有关.
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文献信息
篇名 Yeast基因组编码区特征参数的研究
来源期刊 生物物理学报 学科 生物学
关键词 Yeast基因组 编码区 碱基成分偏移 正相关
年,卷(期) 2001,(3) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 535-541
页数 7页 分类号 Q617
字数 3846字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1000-6737.2001.03.016
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李宏 内蒙古大学理论物理和理论生物物理研究室 160 656 14.0 18.0
2 罗辽复 内蒙古大学理论物理和理论生物物理研究室 101 476 12.0 17.0
3 张颖 内蒙古大学理论物理和理论生物物理研究室 17 139 6.0 11.0
4 吕军 内蒙古大学理论物理和理论生物物理研究室 9 63 4.0 7.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
Yeast基因组
编码区
碱基成分偏移
正相关
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物物理学报
双月刊
1000-6737
11-1992/Q
大16开
北京市朝阳区大屯路15号中国科学院生物物理研究所
1985
chi
出版文献量(篇)
1662
总下载数(次)
4
总被引数(次)
12572
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导