一种基于密码子使用偏性的检测型基因芯片设计方法

• 作者: 周童 孙啸 陆祖宏 顾万君 马建民
• 来源期刊: 东南大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 特定蛋白mRNA检测芯片 密码子使用偏性 C-G选择性分离原则 G-T配对原则 探针优化
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 页码范围: 581-585
• 页数: 5页
• 分类号: Q755
• 字数: 4217字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0505.2002.04.009

摘要

首先预测特定蛋白密码子使用概率表,以确定序列中各氨基酸的编码密码子,这样可以将芯片表面探针的数量减少为原来的4.47%.然后进一步考虑密码子在编码时的C-G选择性分离原则、G-T配对原则,以进一步将芯片表面探针的数量减少至4.25%.在对探针特异性要求不高的情况下,可以采用最优密码子使用概率表,以求最大限度的降低探针的数目,这样芯片表面探针的数量可减少到原来的0.20%.通过上述方法,可以显著提高单位芯片面积的信息检测量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	东南大学吴健雄实验室	71	488	12.0	20.0
2	陆祖宏	东南大学吴健雄实验室	166	1602	19.0	33.0
3	周童	东南大学吴健雄实验室	9	157	5.0	9.0
4	马建民	东南大学吴健雄实验室	6	143	5.0	6.0
5	顾万君	东南大学吴健雄实验室	8	146	5.0	8.0