肠道病毒71型中国分离株基因组3区的分析

• 作者: 何雅青 李良成 杨帆 金奇
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒属 碱基序列
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 354-357
• 页数: 4页
• 分类号: R57
• 字数: 3054字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2003.04.014

摘要

目的测定我国分离的肠道病毒71型(EV71)SHZH98株3C基因的核苷酸序列,进行遗传进化途径的分析.方法用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增我国分离的EV71-SHZH98株3C基因cDNA,测定PCR产物的核苷酸序列.结果 SHZH98株3C基因为549 bp,和已发表的肠道病毒71型3C基因序列比较,SHZH98株与MS株同源性为78.7%,与BrCr株的同源性为76.7%,与台湾分离株POLY、NCKU、TW2086、TW2272株的同源性分别为74.0%、73.8%、71.9%、69.8%.由其核苷酸序列推导的氨基酸序列同源性比较显示与MS的同源性为93.45%,与BrCr、POLY、NCKU、TW2086、TW2272株的同源性分别为89.1%、90.7%、90.2%、84.2%、82.5%.遗传进化分析显示SHZH98株3C片段在亲缘关系上与Coxsackievirus A16 G-10株及欧美分离株MS、BrCr株较密切,而与台湾分离株相差较远.结论推测EV71病毒中国分离株非结构蛋白的进化途径可能与台湾流行株不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金奇	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室	10	220	5.0	10.0
2	何雅青		53	626	13.0	23.0
3	杨帆	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室	4	131	2.0	4.0
4	李良成		6	31	4.0	5.0