人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析I.同义密码子偏爱使用分析

• 作者: 张成 武耀廷 郭家明 陈学平 马飞
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 可变剪接 普通剪接 密码子使用 人类
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: Q987
• 字数: 1391字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-352X.2004.01.001

摘要

人类1号染色体可变剪接(选择性剪接)基因344非冗余蛋白质编码序列(188183密码子)和普通剪接(非可变剪接)基因的386蛋白质编码序列(223116密码子)被用于研究人类密码子使用偏爱模式.全部密码子使用数据分析表明,人类可变剪接基因密码子的偏爱水平显著高于普通剪接基因.在人类1号染色体基因中,密码子第三位置的G+C含量有很大的异质性(0.24～0.95),并且可变剪接基因密码子第三位置平均G+C含量(64.66%)大于普通剪接基因(59.97%).Nc值对GC3s图显示密码子偏爱使用除了受核苷酸组成制约外,其它的因子可能也影响密码子的使用变化.此外,可变剪接基因中以G 或C结尾的密码子比普通剪接基因出现的频率高.密码子使用的差异可能是由可变剪接基因pre-mRNA特有的结构特征和多种剪接模式决定的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	武耀廷	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	13	118	6.0	10.0
2	陈学平	中国科学技术大学经济技术学院	31	379	10.0	19.0
3	郭家明	中国科学技术大学经济技术学院	19	170	6.0	13.0
4	马飞	厦门大学生命科学学院	6	99	3.0	6.0